银杏树的枝条,粗分可分为长枝和短枝两种。银杏树的长枝,主要是延长生长和分权,生长迅速,大年生长量可超过1米。一年生枝浅黄褐色,具椭圆形皮孔,尤以叶柄附近为多。二年生枝灰色,并可见细纹纵裂。长枝每个叶腋均可见到腋芽。长枝的髓心不发达。银杏树的短枝,每年生长量极小,约0.3厘米,一般簇生5~14张叶片。短枝是银杏开花结实的部位。已经进入开花结实期的银杏树,短枝上可以见到三种形状的痕迹:线形痕是芽鳞痕,肾形痕是叶痕,圆形痕是果柄痕。
根据枝条抽生的性质,又可分为延伸枝、顶侧枝、细枝和短果枝等。